Sağlık Bilimlerinde Değer dergisine sistem üzerinden yüklenen her makale, öncelikle Baş Editör veya ilgili Bölüm Editörleri tarafından yazım kuralları ve yayın ilkelerine uygunluk açısından ön değerlendirmeye tabi tutulur. Uygun bulunan makaleler hakem sürecine alınırken, eksik veya uygunsuz görülenler düzeltme yapılması amacıyla yazara iade edilir.

Editör onayından geçen makaleler, alanında uzman ve bağımsız iki hakeme gönderilir. Değerlendirme süreci çift taraflı kör hakemlik (double-blind peer review) ilkesine göre yürütülür; yazar ve hakemlerin kimlikleri birbirlerinden gizli tutulur.

Hakemlerin, kendilerine iletilen makaleyi değerlendirme süresi en fazla 15 gündür. Belirtilen süre içerisinde değerlendirme yapılmadığı takdirde, yeni bir hakem görevlendirilir.

Alan değerlendirmesi sonucunda iki olumlu hakem görüşü alınan makaleler yayımlanmaya uygun kabul edilir. Bir olumlu, bir olumsuz görüş alınması durumunda makale, üçüncü bir hakeme gönderilir; yayınlanma kararı, üçüncü hakemin görüşü ya da editör kararı doğrultusunda verilir.

Yazarlardan istenen düzeltmelerin tamamlanması için verilen süre azami 15 gündür. Editörler, gerekli gördükleri durumlarda bir makalenin yayımlanmasına ya da reddine doğrudan karar verebilirler.

Makale değerlendirme süreci, başvurudan yayımlanmaya kadar ortalama 4 ila 5 ay sürmektedir. Bu sürecin tüm aşamaları elektronik ortamda yürütülmektedir.